Так, в 1612 году ополчение Минина и Пожарского шло на Москву именно с этой иконой, и благодаря ее поддержке смогло одержать победу. На некоторое время икона оставалась в городе, но потом ее вернули обратно в монастырь. Это одно из самых известых чудес, приписываемых Казанской иконе Божией Матери. Но народная молва говорит о том, что их было великое множество. Не даром же, именно к ней со всего Среднего Поволжья тянулись поломники.
Монастырь рос и процветал. К концу XIX века в монастыре было уже более 5 сотен послушниц, площадь его занимала несколько гектаров, а по красоте архитектурного ансамбля он мог соперничать с самыми известными монастырями Российской Империи. Главный собор, Никольский и Крестовоздвиженский были построены в начале XIX века стиле классицизма, из более ранних построек сохранилась колокольня и Софийская надвратная церковь.
В начале XX века в монастыре произошло множество печальных событий.
В 1904 году бесследно пропала главная святыня - икона Божией Матери. В 20-х годах монастырь был упразднена, но здесь все еще действовала православная община, а в 30-х монастырь был подвергнут разрушению, в уцелевших зданиях находилась сначала табачная фабрика, затем филфак Казанского пединститута.
В начале 90-х годов территория монастыря была возвращена верующим, восстановлены Софийская церковь и Крестовоздвиженский храм, в котором находится Ватиканский список казанской иконы Божией Матери. Монастырь сегодня возрождается как мужской.